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Análisis filogenético de Caiman crocodilus (Cope, 1868) en la Costa Atlántica y Pacífica Colombiana empleando marcadores de ADN mitocondrial

Jimenez Alonso, Gonzalo (2016) Análisis filogenético de Caiman crocodilus (Cope, 1868) en la Costa Atlántica y Pacífica Colombiana empleando marcadores de ADN mitocondrial. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia-Sede Bogotá.

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Resumen

Caiman crocodilus es la especie con la distribución más amplia entre los Crocodylia neotropicales. Ocupa toda la franja intertropical desde México, a través de América Central, llegando hasta América del Sur en el centro de Brasil. La sistemática del género Caiman, presente en Centro y Suramérica, es aún objeto de profunda controversia y confusión; las especies reconocidas por algunos autores no son aceptadas por otros como consecuencia de las incongruencias resultantes de los análisis morfológicos y moleculares. Existe además una gran discusión respecto a la existencia o no de las diferentes subespecies de C. crocodilus. Los hallazgos provenientes de estudios recientes en los que se plantean hipótesis de filogenia para la especie no incluyen datos de las subespecies presentes en Colombia, por lo que se desconoce aún el parentesco e identidad taxonómica de las poblaciones de C. crocodilus presentes en el país. Evaluar si las poblaciones de C. crocodilus distribuidas en el Caribe y Pacífico Colombiano representan uno o más linajes es de gran relevancia no solo por la necesidad de dar una respuesta a la controversia taxonómica, sino por la importancia que tiene la especie en el contexto del uso que se le da en el mercado de pieles a nivel mundial. En este trabajo, analizamos la variación molecular de Caiman crocodilus con el objetivo de evaluar el parentesco filogenético de las poblaciones de Caiman crocodilus de la Costa Caribe y Pacífica Colombiana y su correspondencia con el estado taxonómico actual de C. c. fuscus y C. c. chiapasius. La variación molecular fue evaluada con los genes Citocromo b (CytB) y Citocromo oxidasa I (COI). La matriz se construyó con muestras de 78 individuos de 15 localidades distribuidas en las regiones Pacífica y Caribe de Colombia, el Valle del Magdalena y Catatumbo. Se identificaron 10 sitios polimórficos en la secuencia del gen COI y 23 sitios polimórficos en el gen CytB, encontrandose 19 haplotipos distintos. En el presente estudio, el grupo C. c. fuscus/chiapasius se compone de tres subclados que corresponden a: (1) Caiman crocodilus fuscus / Caiman crocodilus chiapasius en México a Honduras, (2) Caiman crocodilus fuscus de Nicaragua al Norte de Costa Rica y (3) Caiman crocodilus fuscus del Sur de Costa Rica a Colombia (Costa Pacífica, Costa Atlántica, Valle del Magdalena y Catatumbo; incluidos los paratipos de la Isla Gorgona. Los haplotipos encontrados en el presente estudio se agruparon en dos haplogrupos en los cuales para el primero se encuentran 11 haplotipos localizados en zona de la costa Atlántica, Valle del Magdalena, Catatumbo y Urabá Chocoano, el segundo haplogrupo se encuentra agrupandos 7 haplotipos los cuales se encuentran localizados en el Pacifico Colombiano y norte del Chocó con áreas de contacto con el primer haplogrupo en la zona del Urabá y en el magdalena medio. Los linajes de Caiman crocodilus mostraron un patrón filogeográfico concordante con atributos fisiográficos presentes en el área de distribución. La fecha de divergencia obtenida mostró que los eventos cladogénicos en Caiman crocodilus coinciden con el periodo má- ximo de orogénesis de las cadenas montañosas en Mesoamérica y en el noroccidente de América del sur durante el Plio-Pleistoceno.

Tipo de documento:Tesis/trabajos de grado - Thesis (Maestría)
Colaborador / Asesor:Calderon Espinosa, Martha Lucia and Bloo, Paul
Información adicional:Maestría en Biología. Línea Genética
Palabras clave:Caiman crocodilus, Citocromo B, Citocromo Oxidasa I, Filogenética, ADN Mitocondrial, Babilla
Temática:5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 59 Animales / Animals
Unidad administrativa:Sede Bogotá > Facultad de Ciencias > Departamento de Biología > Biología
Código ID:55078
Enviado por : Gonzalo Jimenez Alonso
Enviado el día :16 Enero 2017 20:49
Ultima modificación:16 Enero 2017 20:49
Ultima modificación:16 Enero 2017 20:49
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