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Diversidad Genética de gallinas criollas del Suroccidente Colombiano mediante ADN mitocondrial

Revelo Cuaspud, Herman Alberto (2015) Diversidad Genética de gallinas criollas del Suroccidente Colombiano mediante ADN mitocondrial. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira.

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Resumen

La gallina criolla del Pacífico Colombiano es unas especies utilizadas en avicultura no especializada en la población rural, se caracteriza por su importancia social, cultural y económica. Se ha reconocido que la gallina fue introducida en América del Sur en el siglo XV con la llegada de los españoles, aunque se ha planteado una introducción pre-europea a través de contactos transoceánicos entre América, Asia o Polinesia. Algunos científicos han empleado marcadores moleculares de ADNmt para analizar fósiles prehistóricos y gallinas domésticas, pero aún no es claro el origen de la gallina criolla en América del Sur. El objetivo de este trabajo fue contribuir al conocimiento de la diversidad genética de las gallinas criollas del Pacífico Colombiano usando ADNmt. Se secuenció un fragmento de 530pb de la región control de 60 gallinas criollas pertenecientes a tres comunidades correspondientes a indígenas (Nariño), campesinas (Valle del Cauca) y afrodescendientes (Chocó). Las secuencias colombianas fueron analizadas y comparadas con dos conjuntos de datos correspondientes a 3162 secuencias de 480pb y 3223 secuencias de 200pb respectivamente. Los resultados mostraron la existencia de un pool altamente diverso en región hipervariable del ADNmt en las gallinas criollas del Pacífico Colombiano, debido a que 24 sitios polimórficos definieron 13 haplotipos y estos a su vez se agruparon con los haplogrupos E (86,6%), A (6.66%), C (5%) y B (1.66%). De la diversidad genética solo 4.4% de la variación total se debió a diferencias entre las gallinas en las tres comunidades. El índice de fijación (FST) para las tres poblaciones no fue significativo (FST=0.04397±0.045), (P>0.07429), por lo tanto, no se detectó estructura genética. Estos resultados sugieren un origen europeo, dado que los documentos históricos muestran que los españoles la introdujeron. Los haplogrupos A, B y C es probable que hayan llegado al Pacífico Colombiano con la introducción de líneas comerciales., //Abstract: Native hen of the Colombian Pacific is one of the most commonly used species in aviculture not specialized of the rural population and is characterized by its cultural and economic importance. It has been recognized that the hen was introduced in South America in the fifteenth century with the arrival of the Spaniards. Although it has also raised a pre-European introduction, through transoceanic contacts between America, Asia and Polynesia. Some scientists have used molecular markers of mtDNA to analyze prehistoric fossils and nuclear DNA of native hens, but it is not still clear their origin in South America. The objective of the present work went to contribute to the knowledge of the genetic diversity of the native hens of the Colombian Pacific using mitochondrial DNA. A fragment of 530pb was sequenced and amplified of the control region of 60 native hens belonging to three communities: Indigenous (Nariño), peasants (Valle del Cauca) and Afro (Choco). Sequences were analyzed and compared with two groups of data corresponding to 3162 sequences of 480pb and 3223 sequences of 200pb; respectively. The results showed the existence of a highly diverse pool in the region hipervariable of the mtDNA in the native hens of the Colombian Pacific, due to 24 polymorphic sites defined 13 haplotypes and these in turn were grouped with the haplogroups E, A, C and B. In terms of genetic diversity only 4.4% of the total variation was due to differences among hens from the three communities. The fixation index (FST) for the three communities was not significant (FST=0.04397±0.045), (P>0.07429), therefore genetic structure was not detected. These results suggest an European origin, since the historical documents show that the Spaniards introduced. It is probable that the haplogroupsA, B and C have arrived in the Colombian Pacific with the introduction of commercial lines.

Tipo de documento:Tesis/trabajos de grado - Thesis (Maestría)
Colaborador / Asesor:Álvarez Franco, Luz Ángela and Góngora, Jaime
Palabras clave:Ancestría, Aves de traspatio, D-loop, Filogenia, Haplotipo, Ancestry, Birds backyard, Phylogeny, Haplotype, Molecular markers
Temática:5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 59 Animales / Animals
6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology > 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Unidad administrativa:Sede Palmira > Facultad de Ciencias Agropecuarias > Maestría Ciencias Agrarias
Código ID:47490
Enviado por : Tesis Herman Alberto Revelo Cuspud
Enviado el día :25 Mar 2015 14:33
Ultima modificación:27 Enero 2017 14:18
Ultima modificación:27 Enero 2017 14:18
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