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Identification of molecular markers associated with polygenic resistance to Phytophthora infestans through association mapping in Solanum tuberosum group Phureja

Alvarez Vargas, María Fernanda (2014) Identification of molecular markers associated with polygenic resistance to Phytophthora infestans through association mapping in Solanum tuberosum group Phureja. Doctorado thesis, Universidad Nacional de Colombia.

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Resumen

El objetivo principal de esta investigación fue identificar marcadores moleculares asociados a la resistencia a gota en papa Criolla (Solanum Tuberosum grupo Phureja). La metodología utilizada fue mapeo de asociación, metodología implementada por primera vez para el estudio de la genética de caracteres complejos en plantas en Colombia. En este trabajo se evaluó la resistencia en campo de 181 accesiones de la colección central Colombia a de papa (CCC), todos pertenecientes al grupo Phureja. Posteriormente esta información fenotípica se asoció con la caracterización genotípica divida en dos grupos, uno de genes candidatos y otro marcadores de polimorfismos de una única base (SNP, single nucleotide polymorphism) distribuidos en el genoma de papa. Esta asociación se realizó mediante el uso de un modelo estadístico mixto. Lo cual dio como resultado dos genes candidatos y tres SNP asociados con la resistencia cuantitativa a gota en las accesiones del grupo Phureja, que pueden ser candidatos para diseño de marcadores simples para uso en selección asistida por marcadores moleculares, Abstract. The main objective of this research was to find molecular markers associated to quantitative resistance to late blight in group Phureja potatoes. The methodology used was association mapping, this methodology was used for the first time in genetic studies for complex traits in Colombia in this research. Here we phenotype 181 Colombia Core Collection (CCC) accessions of group Phureja germoplasm in the field for late blight resistance. Phenotypic data were associated with genotypic data from two sources, one novel candidate genes and the other single nucleotide polymorphism (SNP) distributed along the potato genome. Association was done using the mixed model approach. As a result we found two novel candidate genes and three SNP associated with quantitative resistance against late blight in the group Phureja accessions

Tipo de documento:Tesis/trabajos de grado - Thesis (Doctorado)
Colaborador / Asesor:Mosquera Vásquez, Teresa
Información adicional:Doctor en Ciencias Agrarias. Línea de Investigación: Genética y fitomejoramiento
Palabras clave:Marcador molecular, SNP, Resistencia cualitativa, Mapeo de asociación, Resistencia a gota, Solanum tuberosum group Phureja, Genes candidatos, Molecular markers, Association mapping, Late blight resistance, Quantitative resistance, Candidate genes
Temática:6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology > 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Unidad administrativa:Sede Bogotá > Facultad de Agronomía > Escuela de Posgrados
Sede Bogotá > Facultad de Ciencias > Facultad de Agronomía > Escuela de Posgrados
Código ID:46589
Enviado por : bdigital4_ bog
Enviado el día :29 Jan 2015 10:07
Ultima modificación:29 Jan 2015 10:07
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