Escudo de la República de Colombia
Sistema Nacional de Biliotecas - Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia Biblioteca Digital - Repositorio Institucional UN Sistema Nacional de Bibliotecas UN

Modelo de evaluación para resolver problemas de filogenia molecular en el género Fusarium, basado en los análisis de microsecuencias de ADN de multilocus conservados

Rincón Sandoval, Cindy Melissa (2014) Modelo de evaluación para resolver problemas de filogenia molecular en el género Fusarium, basado en los análisis de microsecuencias de ADN de multilocus conservados. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.

Texto completo

[img]
Vista previa
PDF - Versión Aceptada
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial No Derivatives.

7MB

Resumen

La filogenia que se hace utilizando métodos moleculares dentro del género Fusarium es controversial, por las diferencias presentadas entre los resultados obtenidos al analizar diferentes genes útiles para hacer filogenia. Al analizar las secuencias de ADN obtenemos arboles con clados que muestran diferentes distribuciones de las especies estudiadas. El presente trabajo explora la posibilidad de utilizar microsecuencias de genes conservados para resolver problemas de clasificación taxonómica y de filogenia de las especies pertenecientes al género Fusarium. Para esto, se evaluaron trece especies del géneroFusarium (F. anthophilum, F. avenaceum, F. culmorum F. equiseti, F. foetens, F. graminearum, F. oxysporum F. proliferatum, F. solani, F. sp., F. sporotrichioides,F. subglutinans, F. verticillioides), utilizando 15 parejas de iniciadores que codifican para las regionesgénicas de: cluster de rDNA, β-tubulina, calmodulina, citocromo oxidasa I, factor de elongación 1-α, histonas 3 y 4 y subunidad pequeña ribosomal de RNA. A partir de los resultados obtenidos podemos concluir que el uso de las microsecuencias altamente variables son la mejor opción para resolver los problemas de un gen una historia evolutiva, debido a que los arboles obtenidos mostraron un alto porcentaje de similaridad entre aquellos arboles producto de diferentes regiones génicas y el árbol de caracteres morfológicos. Además el uso de estas microsecuencias elimina homoplasias y reduce artefactos como saturación y atracción de ramas largas lo cual genera inferenciasfilogenéticas erróneas., Abstract. Molecular phylogenies based on individual or concatenated gene sequences from the genus Fusariumare known to show controversial results: Different (combinations) of DNA sequences may result in at times unresolved trees, with different clade distributions and topologie. Besides, morphological and molecular species characterizations vary. In the present work, we exploit the possibilities of highly variable microsequences , with high percentages of transitions and transversions from phylogenetically useful genes for the construction of phylogenetic trees. Single and concatenated microsequences were used from thirteen Fusarium species, using primers that encode for different genic regions of: the rDNA cluster, β-tubulin, calmodulin, cytochrome oxidase, elongation factor, histones 3 and 4 and small subunit ribosomal RNA gene. Al phylogenetic trees were evaluated with congruence tests.By the results, we conclude that the highly variable microsequences are the best choice to solve those problems because these ended up having a high similarity percent between different genic regions, an accurately approximation between morphological species, and reduce artifacts like saturation and attraction of long branch phenomena that produce erroneous phylogenetic results.

Tipo de documento:Tesis/trabajos de grado - Thesis (Maestría)
Colaborador / Asesor:Filgueira Duarte, Juan José and Aristizábal Gutiérrez, Fabio Ancizar
Información adicional:Magister en Ciencias-Microbiología. Línea de Investigación: Biología Molecular de Agentes Infecciosos
Palabras clave:Fusarium, Filogenómica, Microsecuencias de ADN, Concatenación, DNA micro-sequences, Phylogenomics, Concatenation
Temática:5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
Unidad administrativa:Sede Bogotá > Facultad de Ciencias
Sede Bogotá > Facultad de Ciencias > Posgrado Interfacultades en Microbiología
Código ID:39703
Enviado por : Universidad Nacional de Colombia Biblioteca Digital - Sede Bogotá
Enviado el día :28 Julio 2014 14:19
Ultima modificación:28 Julio 2014 14:19
Ultima modificación:28 Julio 2014 14:19
Exportar:Clic aquí
Estadísticas:Clic aquí
Compartir:

Solamente administradores del repositorio: página de control del ítem

Vicerrectoría de Investigación: Número uno en investigación
Indexado por:
Indexado por Scholar Google WorldCat DRIVER Registry of Open Access Repositories OpenDOAR Metabiblioteca BDCOL OAIster Red de repositorios latinoamericanos DSpace BASE Open archives La referencia Colombiae Open Access Theses and Dissertations Tesis latinoamericanas CLACSO
Este sitio web se ve mejor en Firefox