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Identificación de elementos cis-regulatorios y predicción bioinformática de factores de transcripción involucrados en la regulación de miarns en plantas

Pérez-Quintero, Álvaro and López, Camilo (2013) Identificación de elementos cis-regulatorios y predicción bioinformática de factores de transcripción involucrados en la regulación de miarns en plantas. Acta Biológica Colombiana; Vol. 18, núm. 1 (2013); 107-120 Acta Biológica Colombiana; Vol. 18, núm. 1 (2013); 107-120 1900-1649 0120-548X .

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URL oficial: http://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/art...

Resumen

Los microARNs (miARNs) son pequeños ARN no codificantes que juegan un papel importante en el control de la expresión génica a través de la degradación de ARNm complementarios a su secuencia. La expresión de los miARNs es dependiente de la ARN polimerasa II como la mayoría de genes que codifican para proteínas. La regulación de la expresión de miARNs está bajo el control coordinado y combinatorio de factores de transcripción (FT). En este trabajo, se realizó una aproximación bioinformática para identificar sitios de unión de FT, TFBS (del inglés Transcription Factors Binding Sites) en regiones promotoras de genes miRNAs  en 17 especies vegetales y se analizó el papel de algunos FT en defensa contra bacterias. Se encontró que nueve de las plantas analizadas presentaban diferencias significativas entre la distribución de TFBS presentes en los promotores de los miRNAs cuando se compara con los presentes en los genes codificantes de proteínas. En varios de los promotores de los miRNAs de yuca que son inducidos en respuesta a la infección por la bacteria Xanthomonas axonopodis  pv. manihotis  se identificaron elementos de unión como CCA1, T-box y SORLREP3, los cuales se presentan también en los genes que codifican proteínas implicadas en respuestas al ciclo circadiano y a la luz, sugiriendo que estos procesos y las respuestas inmunes en plantas pueden ser coordinados. En conjunto este trabajo aporta luces sobre los posibles mecanismos transcripcionales del control de la expresión génica de los miARNs.

Tipo de documento:Artículo - Article
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Palabras clave:Ciencias biologicas, biologia molecular, bioinformatica, expresión génica, factores de transcripción, microARN, promotor.
Unidad administrativa:Revistas electrónicas UN > Acta Biológica Colombiana
Código ID:36310
Enviado por : Dirección Nacional de Bibliotecas STECNICO
Enviado el día :02 Julio 2014 13:40
Ultima modificación:18 Agosto 2014 21:29
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