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Detección y cuantificación de spongospora subterranea f. sp. subterranea en plantas señuelo y cultivos de papa en colombia mediante qpcr

García Bastidas, Nevar Alirio and Morales Osorio, Juan Gonzalo and González Jaimes, Eliana Paola and Gutiérrez Sánchez, Pablo Andrés and Marín Montoya, Mauricio Alejandro (2013) Detección y cuantificación de spongospora subterranea f. sp. subterranea en plantas señuelo y cultivos de papa en colombia mediante qpcr. Acta Biológica Colombiana; Vol. 18, núm. 1 (2013); 121-136 Acta Biológica Colombiana; Vol. 18, núm. 1 (2013); 121-136 1900-1649 0120-548X .

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URL oficial: http://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/art...

Resumen

La sarna polvosa de la papa (Solanum tuberosum , S. phureja) causada por Spongospora subterranea f. sp. subterranea (Sss), es una de las enfermedades más limitantes de este cultivo. En Colombia, se han empleado diferentes métodos de detección asintomática de Sss, incluyendo bioensayos con plantas señuelo, PCR de ITS y pruebas de ELISA. Sin embargo, sus niveles de sensibilidad son bajos o requieren tiempos extensos. Una alternativa para complementar dichas herramientas es la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR). En este trabajo se evaluó dicha técnica utilizando los juegos de cebadores SsTQF1-SsTQR1; Spon421F-Spon494R y SscolF-SscolR (diseñados en este estudio), bajo la metodología de SYBR Green®; mientras que con Taqman® se evaluaron los cebadores SponF-SponR y la sonda SponP. Una vez determinada la funcionalidad de los cebadores, se descartó por inespecificidad, el par Spon421F-Spon494R; para los restantes se realizaron curvas estándar basadas en diluciones seriadas de quistosoros. Las pruebas de qPCR detectaron a Sss en las 20 muestras evaluadas de plantas señuelo de Nicotiana benthamiana y papa, utilizando los cebadores SsTQF1-SsTQR1 (Ct: 10,57- 29,34) y SscolF-SscolR (Ct: 14,39-34,08); mientras que 19 de las muestras fueron positivas con SponF-SponR-SponP (Ct: 15,63-38,93). A partir de 20 muestras de raíces de papa de cultivos de La Unión (Antioquia, Colombia), fue posible detectar el patógeno en 17 de ellas con SscolF-SscolR, estimándose una concentración de 6470 a 1,39 x 1010 quistorosos/mL. Estos resultados indican la ocurrencia de altos niveles de inóculo de Sss en esta región y enfatizan en la necesidad de fortalecer los programas de certificación de tubérculo-semilla en Colombia.

Tipo de documento:Artículo - Article
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Palabras clave:Ciencias Agronómicas, Fitopatología, PCR en tiempo real, sarna polvosa, Solanum phureja, Solanum tuberosum.
Unidad administrativa:Revistas electrónicas UN > Acta Biológica Colombiana
Código ID:33415
Enviado por : Dirección Nacional de Bibliotecas STECNICO
Enviado el día :01 Julio 2014 08:53
Ultima modificación:18 Agosto 2014 20:16
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