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Detección e identificación de los virus patógenos de cultivos de Gulupa (Passiflora edulis Sims) en la región del Sumapáz (Cundinamarca) / Detection and identification of pathogenic viruses Gulupa crops (Passiflora edulis Sims) in the region of Sumapaz (Cundinamarca)

Camelo García, Viviana Marcela (2010) Detección e identificación de los virus patógenos de cultivos de Gulupa (Passiflora edulis Sims) en la región del Sumapáz (Cundinamarca) / Detection and identification of pathogenic viruses Gulupa crops (Passiflora edulis Sims) in the region of Sumapaz (Cundinamarca). Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.

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Resumen

El cultivo de gulupa en Colombia representa un nuevo e importante reglón de exportación del sector frutícola. La información y prácticas agronómicas para el sistema de gulupa son extrapoladas de otros cultivos de pasifloras, por lo cual es prioritario investigar sobre los problemas fitosanitarios en esta especie. El objetivo del presente trabajo fue detectar virus que infectan gulupa mediante procedimientos serológicos y moleculares, y definir su identidad mediante secuenciación. El muestreo se realizó en cultivos ubicados en la región del Sumapáz (Cundinamarca). Las plantas evaluadas exhibían síntomas asociados a infección viral, tales como manchas verdes en frutos inmaduros, manchas anulares en frutos maduros, deformación en puntas terminales de ramas, deformación y mosaicos foliares. Se evaluaron tres métodos de extracción de RNA a partir de tejido foliar: Cromatografía en columna de celulosa CF-11 (Whatman), TRIzol y protocolo de extracción para pino. La detección mediante RT-PCR se realizó empleando primers específicos para Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV), Passion fruit yellow mosaic virus (PFYMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Tomato ringspot virus (ToRSV) y Soybean mosaic virus (SMV); adicionalmente, se evaluaron primers degenerados para los géneros Potyvirus y Carlavirus. La presencia de CMV y Potyvirus fue detectada mediante RT-PCR, la evaluación con los otros primers no permitió la detección de los otros virus. La identidad nucleotídica de los productos de PCR obtenidos con primers Potyvirus correspondió a SMV. El análisis serológico mediante ELISA permitió la detección de CMV, SMV, CABMV y Potyvirus. Este trabajo es el primer reporte de infección por SMV y CMV en gulupa. / Abstract. The crop of gulupa in Colombia represents a significant new export screed in the fruit sector. Information and agronomic practices for gulupa system are extrapolated from other pasiflora crops; hence research on plant protection of this specie has been constituted in a priority. The aim of this study was to detect viruses infecting gulupa by serological and molecular procedures, and to define their identity by sequencing. Sampling was performed in crops located in the region of Sumapaz (Cundinamarca). The tested plants exhibited symptoms associated with viral infection, such as green spots on immature fruits, ring spots on mature fruits, deformation on endpoints of branches, leaf deformation and mosaic. We evaluated three methods for RNA extraction from leaf tissue: CF-11 cellulose (Whatman) column chromatography, TRIzol and extraction protocol from pine. The RT-PCR detection was performed using specific primers for Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV), Passion fruit yellow mosaic virus (PFYMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Tomato ringspot virus (ToRSV) and Soybean mosaic virus (SMV). Additionally, degenerate primers were evaluated for the genera Potyvirus and Carlavirus. CMV and Potyvirus infections were detected by RT-PCR, the evaluation with the other primers did not allow the detection of other viruses. The nucleotide identity of PCR Potyvirus products revealed to SMV. The serological analysis by ELISA allowed the detection of CMV, SMV, CABMV and Potyvirus. This work is the first report of SMV and CMV infection in gulupa.

Tipo de documento:Tesis/trabajos de grado - Thesis (Maestría)
Colaborador / Asesor:Oliveros Garay, Óscar Arturo
Información adicional:Magíster en fitopatología
Palabras clave:Extracción RNA; RT-PCR; ELISA; Secuenciación; Soybean mosaic virus; Sequencing; Soybean mosaic virus; Gulupa (Passiflora edulis Sims); Sumapáz, Cundinamarca
Temática:5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology > 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Unidad administrativa:Sede Bogotá > Facultad de Agronomía > Escuela de Posgrados
Sede Bogotá > Facultad de Ciencias > Facultad de Agronomía > Escuela de Posgrados
Código ID:3095
Enviado por : Universidad Nacional de Colombia Biblioteca Digital - Sede Bogotá
Enviado el día :15 Febrero 2011 18:10
Ultima modificación:15 Febrero 2011 18:10
Ultima modificación:15 Febrero 2011 18:10
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