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Implementación de una metodología in silico usando el modelo oculto de Markov para la identificación de proteínas involucradas en el mecanismo de señalización con Ubiquitina en el sistema Uubiquitina-Proteosoma en el parásito Giardia intestinalis / Implementation of a methodology in silico using hidden Markov model for identification of proteins involved in the system of signaling system with Ubiquitin in the Ubiquitin-proteasome in the parasite Giardia intestinalis

Castellanos, Isabel Cristina (2009) Implementación de una metodología in silico usando el modelo oculto de Markov para la identificación de proteínas involucradas en el mecanismo de señalización con Ubiquitina en el sistema Uubiquitina-Proteosoma en el parásito Giardia intestinalis / Implementation of a methodology in silico using hidden Markov model for identification of proteins involved in the system of signaling system with Ubiquitin in the Ubiquitin-proteasome in the parasite Giardia intestinalis. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.

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Resumen

Nosotros desarrollamos un LINUX Bash Script para la identificación del sistema de Ubiquitinación usando el HMM. Identificamos 256 secuencias del sistema de Ubiquitinación en Giardia y seleccionamos una de estas secuencias para su estudio experimental; el ortólogo OTU. La actividad OTU de esta secuencia fue confirmada por primera vez en Giardia y en un organismo protozoario, siendo este el soporte de la pertinencia de nuestra aproximación bioinformática. / Abstract. We developed a LINUX Bash Scrip for the identification the Ubiquitin system using HMM. We identified 256 sequences of the Ubiquitin System in Giardia and one sequence was studied experimentally; it is a OUT ortolog. The OUT activity was confirmed for first time in Giardia and in a one Protozoan organism. This evidence is a supporting the usefulness of this bioinformatics.

Tipo de documento:Tesis/trabajos de grado - Thesis (Maestría)
Colaborador / Asesor:Wasserman Lerner, Moises
Información adicional:Master en ciencias - Bioquímica
Palabras clave:Giardia intestinalis; Bioinformática; Modelo oculto de Markov (HMM); Ubiquitinación; Bioinformatics; Hidden Markov model (HMM); Ubiquitination; OTU
Temática:5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 54 Química y ciencias afines / Chemistry
Unidad administrativa:Sede Bogotá > Facultad de Ciencias > Departamento de Química
Código ID:2695
Enviado por : Universidad Nacional de Colombia Biblioteca Digital - Sede Bogotá
Enviado el día :04 Enero 2011 17:38
Ultima modificación:14 Febrero 2011 23:43
Ultima modificación:14 Febrero 2011 23:43
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