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The genomic identification of colombian acinetobacter baumannii clinical isolates by rflp-pcr analysis of the 16s-23s rrna gene spacer region

Hernández, María Andrea and Valenzuela, Emilia María and Pulido, Ingrid Yamile and Reguero, María Teresa and Restrepo, Silvia and Gualtero Trujillo, Sandra and Santofimio Sierra, Dagoberto and Ramirez Plazas, Martha and Quintero, Luz Eneida and Mantilla, José Ramón (2011) The genomic identification of colombian acinetobacter baumannii clinical isolates by rflp-pcr analysis of the 16s-23s rrna gene spacer region. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 13, núm. 1 (2011); 110-114 1909-8758 0123-3475 .

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Resumen

Identificación genómica de aislamientos colombianos de Acinetobacter baumannii mediante RFLP-PCR de la región intergénica espaciadora de los genes 16S y 23S rRNAAbstractThe 16S-23S rRNA gene intergenic spacer (ITS) was analysed by RFLP in this study to identify A. baumannii from 139 isolates from four hospitals (identified as A, B, C and D). One hundred and twenty of these isolates (86.3%) belonged to the A. baumannii species; those identified as being A. baumannii were found to be polyclonal (19 clone groups) when determining the genetic relationships, 16 of them being found in hospital C. Hospitals A, B and D shared two clone groups isolated during different years. This study describes a rapid and easy method for genospecies identification of Acinetobacter baumannii. Keywords: Acinetobacter baumannii-Acinetobacter calcoaceticus complex; 16S-23S rRNA gene intergenic spacer (ITS); RFLP-PCR. ResumenCon el objeto de identificar la genomoespecie Acinetobacter baumannii, se estudiaron 189 aislamientos pertenecientes al Complejo Acinetobacter baumannii-Acinetobacter calcoaceticus provenientes de cuatro hospitales colombianos (denominados A,B,C,D) mediante el análisis por RFLP-PCR de la región intergénica espaciador (ITS) de los genes 16S y 23S rRNA. Se encontraron 120 aislamientos (86.3%) pertenecientes a la especie A. baumannii. La estructura de la población fue policlonal, con 19 grupos clonales, 16 de los cuales se hallaron en el hospital C. En los hospitales A,B y D se encontraron 2 grupos clonales aislados durante diferentes años. En este estudio se propone un método rápido y fácil para la identificación de Acinetobacter baumannii Palabras clave: Complejo Acinetobacter baumannii-Acinetobacter calcoaceticus;  Región intergénica espaciadora (ITS), RFLP-PCR.

Tipo de documento:Artículo - Article
Palabras clave:Acinetobacter baumannii-Acinetobacter calcoaceticus complex, 16S-23S rRNA gene intergenic spacer (ITS), RFLP-PCR, Complejo Acinetobacter baumannii-Acinetobacter calcoaceticus, Región intergénica espaciadora (ITS), RFLP-PCR
Unidad administrativa:Revistas electrónicas UN > Revista Colombiana de Biotecnología
Código ID:25563
Enviado por : Dirección Nacional de Bibliotecas STECNICO
Enviado el día :27 Junio 2014 16:43
Ultima modificación:18 Agosto 2014 17:13
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